Существует множество приложений, которые работают только в том случае, если у меня есть учетная запись, и за некоторые из них мне приходится платить за эту учетную запись, поэтому, не зная специфики, нет ничего, что сразу исключало бы вашу модель подписки. Есть даже приложения Apple, например iDisk, которые бесполезны, если у вас нет мобильной подписки стоимостью 100 долларов США.
Если есть проблемы, вы можете рассматривать продажу своей подписки как покупку в приложении (Apple возьмет их 30%, что должно сделать их счастливыми) или посмотреть, как сделать приложение более функциональным без подписки.
В любом случае, при отправке на утверждение убедитесь, что настроили образец учетной записи с полной подпиской, которую могут использовать тестеры яблок (в представлении есть место для включения логинов для такого рода вещей).