XSD - это XML, так что, конечно, вы можете анализировать его в JDOM и манипулировать им так, как вам нравится.
На этот вопрос лучше всего ответить экспериментатор - почемуне просто попробовать и посмотреть?Вы могли бы ответить на это сами за 28 минут, прошедших с того момента, как вы опубликовали свой вопрос.