Основное различие между тем, что site.xml предоставляет информацию о том, где сайт обновления и другая информация репо, может быть структурирована, и она является частью сайта обновления, но с 3.4 она была заменена на content.xml иartifacts.xml
В категории есть XML-файл, описывающий категории, он может использоваться во время сборки p2 и генерирует категории, отображаемые в диалоговом окне «Справка> Установить новое программное обеспечение».Но опять же, с помощью p2, category.xml можно заменить дочерним репозиторием в комбинированном репо, содержащем информацию, которую вы ожидаете.