Вы никогда обращаетесь к базе данных sqlite напрямую при использовании Core Data.
Добавьте поле программно с помощью методов Core Data (работа с моделью) или при использовании инструмента графического моделированияфайл xcdatamodel), добавьте его туда.
Вам также может понадобиться модель миграции модели.Возможно, проверьте документ Core Data на Управление версиями .