Итак, когда я добавляю свой файл .htaccess, который содержит следующее:
# Use PHP5 php.ini as default
AddHandler application/x-httpd-php5 .php
AcceptPathInfo On
RewriteEngine On
RewriteCond %{REQUEST_FILENAME} !-f
RewriteCond %{REQUEST_FILENAME} !-d
RewriteRule .* index.php/$0 [L,QSA]
Сервер пытается загрузить файл PHP вместо его выполнения.Когда я удаляю файл .htaccess, все работает нормально и файлы PHP запускаются.