Посмотрите на полностью определенные имена классов, отфильтруйте, по каким из них они соответствуют указанному вами неквалифицированному имени класса, и, если их несколько, попросите пользователя уточнить выбор. Я слишком долго был вне цикла разработки Eclipse, чтобы помнить, есть ли для этого библиотечная функция, но написать ее довольно просто.