подробный ответ Лоуренса, пример: принудительное выделение js:
первая строка файла, для которого вы хотите получить нужное выделение: # vim: ft=javascript
Если вы хотите, то можете отклониться отсхема цветов по умолчанию через .vimrc:
autocmd FileType javascript colorscheme badwolf