import sys
sys.path.append('/absolute/whatever/project/django_project/django_app1')
sys.path.append('/absolute/whatever/project/django_project/django_app2')
Хотя вам нужно оценить, хотите ли вы, чтобы оба были на вашем пути - на случай, если в обоих есть конкурирующие имена модулей.Возможно, имеет смысл иметь до django_project
на вашем пути и вызывать django_app1/bar1.py
, когда вам это нужно, и import django_app2.bar2.whatever
, когда вам это нужно.