Загрузка сборок - это дорогостоящая операция, однако после загрузки сборки ее нельзя выгрузить, если не выгружен весь домен приложения.Профилирование все относительно.Если вы профилируете запуск приложения, то да, загрузка сборки будет отображаться как основное узкое место, но в течение более длительного периода времени относительный процент времени, потраченного на загрузку сборок, должен быть намного ниже.