Похоже, вы можете использовать следующее решение.
Но мне пришлось создать страницу ASP.net внутри моего решения MVC, которая получает прямой доступ для обработки аутентификации Windows, а затем перенаправляет насайт MVC.Тогда раздел местоположения внутри web.config должен работать, так как он не зависит от маршрутизации.