Я понял это.
1) Загрузите / установите упаковщик fmdiff отсюда:
http://www.defraine.net/~brunod/fmdiff/
2) В Komodo IDE 6 (Komodo Edit не имеет контроля исходного кода):
Настройки> Контроль исходного кода> Subversion
3) Установите флажок «использует внешний инструмент div» и установите следующие параметры различия:
--diff-CMD = / путь / к / fmdiff
(Спасибо Тому на форуме сообщества activestate за помощь в этом)