Используйте плагин firefox Live Headers , чтобы проверить коды возврата, заданные вашим сервером, и перенаправленные URL-адреса. Он сообщит вам, правильно ли установлено перенаправление на 301. Для отладки правил htaccess вам нужно будет получить доступ к журналам на вашем сервере apache, которые вам могут или не могут быть простыми для просмотра.
Возможно, проблема с инструментами для веб-мастеров, или у Google есть кэшированная версия ... добро пожаловать в Интернет!
Если вы хотите сделать это без использования htaccess, используйте канонические теги, которые поддерживаются Google et. и др. также послужит той же цели - поместить весь сок ссылок на более симпатичный URL.