Вы имеете в виду присоединение источников с использованием m2eclipse?
Если это так, вам просто нужно убедиться, что исходные файлы находятся в одном каталоге. Я попытался сделать это, скопировав commons-io-1.4.jar в другой каталог и установив системный путь, если commons-io-1.4-sources.jar находится в том же каталоге, m2eclipse находит и присоединяет источники.
<dependency>
<groupId>commons-io</groupId>
<artifactId>commons-io</artifactId>
<version>1.4</version>
<scope>system</scope>
<systemPath>C:\test\lib\commons-io-1.4.jar</systemPath>
</dependency>
И исходная банка:
C:\test\lib\commons-io-1.4-sources.jar
Полагаю, это будет работать для javadoc, но не пробовал.