Обычно вы не помещаете файлы dll и свойства в jar. Файлы свойств, а также другие файлы JAR должны быть добавлены в путь к классам. Файл jar содержит файл манифеста, который определяет используемый путь к классам. Вы не можете редактировать это с затмением. Вам нужно определить файл ant build.xml и сделать что-то вроде этого:
<jar jarfile="${dist}/MyJar.jar" basedir="${build}">
<manifest>
<attribute name="Main-Class" value="MyClass"/>
<attribute name="Class-Path" value="."/>
</manifest>
</jar>
Затем поместите файл свойств в ту же папку, что и jar. Вы можете запустить цель ant, щелкнув правой кнопкой мыши файл build.xml и выбрав «Запуск от цели Ant».
Если я правильно помню, размещение dll-файла в каталоге bin jre будет работать.