Проблема с запуском JAGUAR в R - PullRequest
       13

Проблема с запуском JAGUAR в R

2 голосов
/ 10 августа 2010

Windows XP, R 2.11.1, Java JRE6

Я только что установил пакет Jaguar.

С консоли R я могу сделать это:

> library(JGR)
Loading required package: rJava
Loading required package: JavaGD
Loading required package: iplots

Please use the corresponding JGR launcher to start JGR.
Run JGR() for details. You can also use JGR(update=TRUE) to update JGR.

и поэтому JGR, кажется, правильно установлен.

JGR() дает

On Windows JGR must be started using the JGR.exe launcher.
Please visit http://www.rosuda.org/JGR/ to download it.
> 

Я не уверен, как запустить Jaguar - я знаю, что мне нужно запустить jgr.exe - ноR должен быть уже открыт?Если так, должна ли библиотека JGR быть уже загружена?Я пробовал все это, и то, что, кажется, происходит независимо от того, что окно консоли открывается на короткое время, а затем исчезает.Я запустил jrg --debug без видимого сообщения об ошибке: (один и тот же файл независимо от сделанного выше выбора).

Что мне делать?

Спасибо!

Система: версия 5.1 (сборка 2600), платформа 2 [Service Pack 3]

JGR loader version 1.61 (build Jul 23 2008)

parseParams> 1 parameters parsed.
parseParams par 10> "--debug"
> rhome="C:\Program Files\R\R-2.11.1"
> srhome="C:\PROGRA~1\R\R-211~1.1"

getPkgVersion(JGR): 010702
getPkgVersion(rJava): 000805
getPkgVersion(JavaGD): 000503
getPkgVersion(iplots): 010103

Loading preferences from "C:\Documents and Settings\gblais\.JGRprefsrc"
> javakey="Software\JavaSoft\Java Runtime Environment\1.6"
> javah="C:\Program Files\Java\jre6"
> tp="C:\Perl\site\bin;C:\Perl\bin;C:\PHP\;C:\Program Files\MiKTeX 2.8\miktex\bin;C:\Python26\Lib\site-packages\PyQt4;C:\Program Files\Tcl\bin;C:\oracle\product\10.2.0\client_2\BIN;C:\WINDOWS\system32;C:\WINDOWS;C:\WINDOWS\System32\Wbem;C:\WINDOWS\system32;C:\WINDOWS;C:\WINDOWS\System32\Wbem;C:\Program Files\Support Tools\;c:\belfry;c:\belfry\usr\local\wbin;C:\WINDOWS;C:\WINDOWS\System32;C:\WINDOWS\System32\WBEM;c:\Program Files\QuickTime\QTSystem\;C:\Program Files\SlikSvn\bin\;c:\progra~1\Microsoft Visual Studio 9.0\VC\bin\"
Got RuntimeLib from registry, using "C:\Program Files\Java\jre6\bin\client;" PATH prefix.
Java home: "C:\Program Files\Java\jre6"
R home: "C:\Program Files\R\R-2.11.1"
JAR files: "-Drjava.class.path=C:\PROGRA~1\R\R-211~1.1\library\rJava\jri\JRI.jar;C:\PROGRA~1\R\R-211~1.1\library\iplots\java\iplots.jar;C:\PROGRA~1\R\R-211~1.1\library\JGR\java\JGR.jar;C:\PROGRA~1\R\R-211~1.1\etc\classes;C:\PROGRA~1\R\R-211~1.1\etc\classes.jar"
desired PATH: "C:\Program Files\Java\jre6\bin\client;C:\Program Files\Java\jre6\bin\client;C:\Program Files\Java\jre6\bin;C:\Program Files\R\R-2.11.1\bin;C:\PROGRA~1\R\R-211~1.1\library\rJava\jri;C:\Perl\site\bin;C:\Perl\bin;C:\PHP\;C:\Program Files\MiKTeX 2.8\miktex\bin;C:\Python26\Lib\site-packages\PyQt4;C:\Program Files\Tcl\bin;C:\oracle\product\10.2.0\client_2\BIN;C:\WINDOWS\system32;C:\WINDOWS;C:\WINDOWS\System32\Wbem;C:\WINDOWS\system32;C:\WINDOWS;C:\WINDOWS\System32\Wbem;C:\Program Files\Support Tools\;c:\belfry;c:\belfry\usr\local\wbin;C:\WINDOWS;C:\WINDOWS\System32;C:\WINDOWS\System32\WBEM;c:\Program Files\QuickTime\QTSystem\;C:\Program Files\SlikSvn\bin\;c:\progra~1\Microsoft Visual Studio 9.0\VC\bin\"
actual PATH: "C:\Program Files\Java\jre6\bin\client;C:\Program Files\Java\jre6\bin\client;C:\Program Files\Java\jre6\bin;C:\Program Files\R\R-2.11.1\bin;C:\PROGRA~1\R\R-211~1.1\library\rJava\jri;C:\Perl\site\bin;C:\Perl\bin;C:\PHP\;C:\Program Files\MiKTeX 2.8\miktex\bin;C:\Python26\Lib\site-packages\PyQt4;C:\Program Files\Tcl\bin;C:\oracle\product\10.2.0\client_2\BIN;C:\WINDOWS\system32;C:\WINDOWS;C:\WINDOWS\System32\Wbem;C:\WINDOWS\system32;C:\WINDOWS;C:\WINDOWS\System32\Wbem;C:\Program Files\Support Tools\;c:\belfry;c:\belfry\usr\local\wbin;C:\WINDOWS;C:\WINDOWS\System32;C:\WINDOWS\System32\WBEM;c:\Program Files\QuickTime\QTSystem\;C:\Program Files\SlikSvn\bin\;c:\progra~1\Microsoft Visual Studio 9.0\VC\bin\"
getenv PATH: "C:\Perl\site\bin;C:\Perl\bin;C:\PHP\;C:\Program Files\MiKTeX 2.8\miktex\bin;C:\Python26\Lib\site-packages\PyQt4;C:\Program Files\Tcl\bin;C:\oracle\product\10.2.0\client_2\BIN;C:\WINDOWS\system32;C:\WINDOWS;C:\WINDOWS\System32\Wbem;C:\WINDOWS\system32;C:\WINDOWS;C:\WINDOWS\System32\Wbem;C:\Program Files\Support Tools\;c:\belfry;c:\belfry\usr\local\wbin;C:\WINDOWS;C:\WINDOWS\System32;C:\WINDOWS\System32\WBEM;c:\Program Files\QuickTime\QTSystem\;C:\Program Files\SlikSvn\bin\;c:\progra~1\Microsoft Visual Studio 9.0\VC\bin\"
argv[0]:C:\PROGRA~1\Java\jre6\bin\java.exe
argv[1]:-Drjava.class.path=C:\PROGRA~1\R\R-211~1.1\library\rJava\jri\JRI.jar;C:\PROGRA~1\R\R-211~1.1\library\iplots\java\iplots.jar;C:\PROGRA~1\R\R-211~1.1\library\JGR\java\JGR.jar;C:\PROGRA~1\R\R-211~1.1\etc\classes;C:\PROGRA~1\R\R-211~1.1\etc\classes.jar
argv[2]:-Xmx512m
argv[3]:-cp
argv[4]:C:\PROGRA~1\R\R-211~1.1\library\rJava\java\boot
argv[5]:-Drjava.path=C:\PROGRA~1\R\R-211~1.1\library\rJava
argv[6]:-Dmain.class=org.rosuda.JGR.JGR
argv[7]:-Djgr.load.pkgs=yes
argv[8]:-Djgr.loader.ver=1.61
argv[9]:RJavaClassLoader
argv[10]:--debug

1 Ответ

0 голосов
/ 05 января 2011

Вы пробовали инструкции с сайта JGR ?

1005 *

Инструкция по установке:

  1. Загрузите и установите R 2.5.0 или выше (Linux / Solaris: make конечно, --enable-R-shlib использовался, когда компиляция R)
  2. Загрузите соответствующее приложение JGR для вашей ОС сверху (Windows / Mac OS X) или установите JGR пакет от CRAN.
  3. Запустите приложение JGR! JGR установит все необходимые пакеты прямо из КРАНА (или РосСуда сервер). (У тебя должно быть права администратора, чтобы получить пакеты установлены)
  4. После успешного завершения шага 3 JGR полностью установлен и может быть использован.

Пользователи Windows: если у вас установлено более одной версии JDK, вы можно использовать этот крошечный инструмент, чтобы выбрать версия по умолчанию, которая будет использоваться с JGR:. jselect.exe 1024 *

Средство запуска Windows принимает следующая необязательная командная строка Параметры:

- debug - показать отладочную информацию и создать c: /jgrdebug.txt (должен быть первый параметр, если используется)

- rforge - использовать www.rforge.net для установки пакета вместо CRAN (полезно установить последнюю разработку пакеты)

- cran = xxx - использовать xxx в качестве зеркала CRAN для установки пакета

- libs = xxx - использовать xxx в качестве местоположения пакета (используйте, только если у вас нет разрешение на запись в R по умолчанию местоположение пакета)

Добро пожаловать на сайт PullRequest, где вы можете задавать вопросы и получать ответы от других членов сообщества.
...