Предполагая, что у вас нет доступа к файловой системе сервера, тогда, если у каждого каталога нет индекса файлов, которые он содержит, вы не можете быть гарантированы для достижения этого.
Обычным способом было бы использовать веб-сканер и надеяться, что все файлы, на которые вы хотите, ссылаются с найденных вами страниц.