Существует известная проблема с подключением WAS v7 к WMQ V6, когда MDB не переподключаются. APAR упоминает сбои после сбоя WMQ, но другие типы сбоев могут привести к аналогичному поведению.
В общем, советуем перейти на WMQ v7, поскольку WMQ V6 не работает с сентября 2011 года. Исправление было выпущено в v7.0.1.1 и более поздних версиях. Пакет исправлений v6 не указан для доставки этого APAR, хотя и не упоминается почему. Поэтому, если вы не можете выполнить обновление до v7.0.1.1 или более поздней версии, получите через PMR и примените IC64098 и посмотрите, решит ли это проблему.
Ссылки:
PSP # 1316899: Информация об использовании поставщика сообщений WebSphere MQ для WebSphere Application Server версии 7.0
IBM IC64098 : приложение не подключается автоматически к диспетчеру очереди, если соединение теряется при использовании адаптера MQ RESOURCE