Вам необходимо избежать обратной косой черты, например,
var commandtoRun = "C:\\Documents and Settings\\User\Desktop\\ABCD.exe";
Обновление:
Это прекрасно работает на моей машине:
var oShell = new ActiveXObject("Shell.Application");
var commandtoRun = "C:\\Windows\\notepad.exe";
oShell.ShellExecute(commandtoRun,"","","open","1");
Обновление 2
Вы можете сохранить это как файл с расширением .hta
, и оно должно работать в вашем браузере:
<HTA:APPLICATION ID="oMyApp"
APPLICATIONNAME="Application Executer"
BORDER="no"
CAPTION="no"
SHOWINTASKBAR="yes"
SINGLEINSTANCE="yes"
SYSMENU="yes"
SCROLL="no"
WINDOWSTATE="normal">
<script type="text/javascript" language="javascript">
var oShell = new ActiveXObject("Shell.Application");
var commandtoRun = "C:\\Windows\\notepad.exe";
oShell.ShellExecute(commandtoRun,"","","open","1");
</script>