Я наткнулся на Mongoid, у которого есть отличная документация: http://mongoid.org/docs/associations/
Но я слышал, что MongomMapper де-факто для Rails.
Где найти документацию по API для использования Mongomapper?
Это сейчас на rdoc.info: http://rdoc.info/github/jnunemaker/mongomapper
MongoMapper теперь имеет документацию по http://mongomapper.com
Стандартный ответ автора MongoMapper заключается в том, что проект еще молод, а API все еще в движении. Загрузите последнюю версию с Git и посмотрите на тесты. Вы должны быть в состоянии понять, что возможно.