Возможно, вы установили пакеты как root (если вы используете Linux) и пытаетесь удалить пакет как обычный пользователь.
Запустите сеанс R от имени root (sudo R) и попробуйте удалить(см .: ?remove.packages
) пакеты в этой среде.Или из консоли: sudo R CMD REMOVE (package name)
Если все еще не работает, пожалуйста, напишите больше о сообщениях об ошибках.