Проблема с использованием версии Python, поставляемой с вашей ОС, заключается в том, что она может содержать ошибки или быть ограничена другими способами. Если вы устанавливаете Python из Fink или MacPorts, вы можете обновить его.
Другое важное преимущество управления собственной версией Python с помощью менеджера пакетов (Fink или MacPorts) заключается в том, что они очень помогают при компиляции зависимостей модуля (например, когда вы используете модуль зависит от скомпилированного кода C). Таким образом, установка модулей Python, безусловно, будет проще, если вы не используете Python, поставляемый с OS X. Это важный момент, который необходимо учитывать, прежде чем сделать свой выбор.