Там должно быть без проблем, при условии, что вы прекрасно знаете, что делать и как это делать.
Но , вы должны спросить себя, почему вы хотитесделать это?Это не дополнение к вашему проекту.Он только маскирует (некоторые из) ваших итераций, что может быть удобно позже, чтобы понять ваш рабочий процесс или объяснить его кому-то еще.
Лично я бы просто слил вашу ветку с основной веткой безудаляя любые изменения вообще.Нечего стыдиться, верно?