Вы можете разрабатывать в NetBeans и использовать C-Ruby (он же MRI Ruby). Просто установите Ruby отдельно, перейдите на Ruby Platforms и выберите его. Я настоятельно рекомендую вам в любом случае установить отдельный Ruby, независимо от того, является ли он MRI Ruby, потому что если вы используете встроенную версию JRuby для NetBeans (которая часто не самая последняя), а затем обновляете NetBeans, вы потеряете все гемы Вы установили. Установка Ruby / JRuby вне NetBeans поможет вам лучше управлять версиями и гемами.
Теперь, чтобы ответить на ваши вопросы: скорее всего, у вас не возникнет проблем с базовыми приложениями на Rails. Если вам когда-нибудь понадобится использовать не родные библиотеки, у вас могут возникнуть проблемы. Некоторые драгоценные камни (например, Nokogiri) имеют C-версию и Java-версию, так что с вами все будет в порядке, но если вы хотите использовать плагин, основанный, например, на RMagick, вы будете бороться, так как вы, вероятно, пойдете другим путем. маршрут, если вы разрабатывали и развертывали с JRuby.
Итог: я бы не рекомендовал это. Я бы порекомендовал использовать одну и ту же платформу для обоих. Но вы можете использовать MRI Ruby в NetBeans.