Существует Selenium-Flex API .Я считаю, что это требует инструментария ваших SWF-файлов, так что их элементы управления фактически вызываются JavaScript, но включает в себя инструмент для этого инструментария.
Я не пробовал это, но возможно, когда у меня есть время ...
РЕДАКТИРОВАТЬ:
Только что заметил, что вы ссылались на это не работает для вас в комментариях уже.Если вам нужно вызвать его из Perl, это действительно может быть невозможно.Я должен быть реальным пользователем этого, чтобы знать.