Поместите его в каталог соответствующего приложения. Например, если у вас есть проект вроде:
my_project/
my_app/
models.py
views.py
tests.py
Воткните сюда:
my_project/
my_app/
management.py
models.py
views.py
tests.py
(Это сделает модуль управления в пакете * my_app * в терминологии Python.)