Что сработало для меня в локальной установке Windows 7 x64 для MYSQL 5.6 было:
Откройте файл my.ini и убедитесь, что у вас есть следующие строки:
Длинный журнал запросов
long_query_time = 1
slow_query_log = 1
slow_query_log_file = "C:\Zend\MySQL5.6\slowquery.log"
Установить общий журнал
general_log=1
general_log_file = "C:\Zend\MySQL5.6\genquery.log"
Сохранить файл и перезапустить службу
Для переключенияотключите общие журналы запросов, установите значение general_log равным 0 и перезапустите.И не забудьте изменить пути к файлам журналов в соответствии с вашей системой.