JMeter - это Java-приложение, но, конечно, оно также может использоваться для веб-сервисов .NET. Вы можете создавать сценарии (отправлять запросы SOAP) и отслеживать результаты как в текстовом, так и графическом виде. Он может эмулировать условия с высоким трафиком и в целом очень настраиваем.
У меня нет специальных советов по тестированию веб-сервисов, кроме того, что вам обязательно нужно провести стресс-тест в условиях большой нагрузки.
Что касается запуска тестов в сценарии, существует ant task для запуска JMeter. Поскольку вы создаете .NET-сервисы, я понимаю, что это может означать слишком много работы для настройки среды тестирования. Конечно, есть Nant, но я не знаю, совместимо ли оно с конкретной задачей.