Проблема в том, что вам нужно определить путь к классу из самого класса.Это не самая простая вещь.
Лучше всего проанализировать файл с помощью такого инструмента, как asm.objectweb.org, найти пакет класса и вывести корень classpath из комбинациипакета класса и имя файла.Даже тогда вы предполагаете, что этот класс использует только классы в этом одном каталоге файлов.