Цикл по переменным в ggplot

Question

Я хочу использовать ggplot для зацикливания нескольких столбцов, чтобы создать несколько графиков, но использование заполнителя в цикле for изменяет поведение ggplot.

Если у меня есть это:

t <- data.frame(w = c(1, 2, 3, 4), x = c(23,45,23, 34), 
y = c(23,34,54, 23), z = c(23,12,54, 32))

Это прекрасно работает:

ggplot(data=t, aes(w, x)) + geom_line()

Но это не так:

i <- 'x'
ggplot(data=t, aes(w, i)) + geom_line()

Что является проблемой, если я хочу в конечном итоге зациклить на x, y и z. Любая помощь?

Answer 1

Вам просто нужно использовать aes_string вместо aes, например так:

ggplot(data=t, aes_string(x = "w", y = i)) + geom_line() 

Обратите внимание, что w также необходимо указать в виде строки.

Answer 2

ggplot2 v3.0.0, выпущенный в июле 2018 года, поддерживает оценку аккуратности, например !! (bang bang) внутри aes(). Таким образом, мы можем сделать следующее:

• Создайте функцию, которая принимает имена столбцов x- и y в качестве входных данных. Обратите внимание на использование rlang::sym & !!.

• Затем переберите все столбцы, используя purrr::map.

library(rlang)
library(tidyverse)

dt <- data.frame(
  w = c(1, 2, 3, 4), x = c(23, 45, 23, 34),
  y = c(23, 34, 54, 23), z = c(23, 12, 54, 32)
)

Определить функцию, которая принимает строки в качестве входных данных

plot_for_loop <- function(df, .x_var, .y_var) {

  # convert strings to variable
  x_var <- sym(.x_var)
  y_var <- sym(.y_var)

  # unquote variables using !! 
  ggplot(df, aes(x = !! x_var, y = !! y_var)) + 
    geom_point() + 
    geom_line() +
    labs(x = x_var, y = y_var) +
    theme_classic(base_size = 12)
}

Цикл по каждому столбцу

plot_list <- colnames(dt)[-1] %>% 
  map( ~ plot_for_loop(dt, colnames(dt)[1], .x))

# view all plots individually (not shown)
plot_list

# Combine all plots
library(cowplot)
plot_grid(plotlist = plot_list,
          ncol = 3)

Редактировать : указанная выше функция также может быть записана без sym и !!

plot_for_loop2 <- function(df, x_var, y_var) {

  ggplot(df, aes(x = .data[[x_var]], y = .data[[y_var]])) + 
    geom_point() + 
    geom_line() +
    labs(x = x_var, y = y_var) +
    theme_classic(base_size = 12)
}

Или мы можем просто использовать facet_grid / facet_wrap после преобразования кадра данных из широкоформатного формата в длинный (tidyr::gather)

dt_long <- dt %>% 
  tidyr::gather(key, value, -w)
dt_long
#>    w key value
#> 1  1   x    23
#> 2  2   x    45
#> 3  3   x    23
#> 4  4   x    34
#> 5  1   y    23
#> 6  2   y    34
#> 7  3   y    54
#> 8  4   y    23
#> 9  1   z    23
#> 10 2   z    12
#> 11 3   z    54
#> 12 4   z    32

### facet_grid
ggp1 <- ggplot(dt_long, 
       aes(x = w, y = value, color = key, group = key)) +
  facet_grid(. ~ key, scales = "free", space = "free") +
  geom_point() + 
  geom_line() +
  theme_bw(base_size = 14)
ggp1

### facet_wrap
ggp2 <- ggplot(dt_long, 
       aes(x = w, y = value, color = key, group = key)) +
  facet_wrap(. ~ key, nrow = 2, ncol = 2) +
  geom_point() + 
  geom_line() +
  theme_bw(base_size = 14)
ggp2

### bonus: reposition legend
# https://cran.r-project.org/web/packages/lemon/vignettes/legends.html
library(lemon)
reposition_legend(ggp2 + theme(legend.direction = 'horizontal'), 
                  'center', panel = 'panel-2-2')

Answer 3

Проблема в том, как вы получаете доступ к фрейму данных t.Как вы, наверное, знаете, есть несколько способов сделать это, но, к сожалению, использование символа, очевидно, не является одним из них в ggplot.

Один из способов, который может работать, - это использовать числовое положение столбца в вашем примере.Например, вы можете попробовать i <- 2.Однако, если это работает, опирается на ggplot, который я никогда не использовал (но я знаю другую работу Хэдли, и я думаю, она должна работать)

Еще один способ обойти это, создавая новый временный фрейм данных каждый раз, когда выпозвоните в ggplot.например:

tmp <- data.frame(a = t[['w']], b = t[[i]])
ggplot(data=tmp, aes(a, b)) + geom_line()

Answer 4

В зависимости от того, что вы пытаетесь сделать, я считаю, facet_wrap или facet_grid хорошо работают для создания нескольких графиков с одинаковой базовой структурой. Что-то вроде этого должно привести вас в правильное положение:

t.m = melt(t, id="w")
ggplot(t.m, aes(w, value)) + facet_wrap(~ variable) + geom_line()