truncate сохранит файловые указатели без изменений и удалит их содержимое. Ведение журнала продолжится, дисковое пространство будет освобождено, и вам не нужно будет перезапускать какой-либо процесс (tomcat).
возможно реализовать ротацию журналов таким образом, если вы копируете файл в какое-либо место резервного копирования
truncate -s 0 catalina.out