Вы можете установить для StageScaleMode значение NO SCALE, но вы также можете определить заданную ширину и высоту swf, эти размеры могут быть определены как в вашем коде, так и в коде встраивания HTML.
Когда вы говорите, независимо от того, где он запущен, это также означает, что вы должны иметь некоторую форму контроля над методом внедрения SWF-файла.