Я предполагаю, что ветвь, над которой вы работаете, это ветка для trunk
(я назову ее old-trunk
). Просто создайте новую ветку оттуда
git checkout -b real-trunk remotes/trunk
Теперь внесите изменения в real-trunk
и подтвердите оттуда. После этого просто перенесите старую ветку на новую.
git svn dcommit
git checkout old-trunk
git rebase real-trunk
Теперь ваши предыдущие изменения основаны на более недавних изменениях, которые вы только что сделали.