Если ваш InnoDB отключается после обновления на mysql-сервере, то сначала необходимо установить plugin-load при запуске сервера, используя
[mysqld]
plugin-load = "myplugin_1 = myplugin_1.so; myplugin_2 = myplugin_2.so";
И затем укажите путь к plugin_dir (каталог подключаемых модулей)это можно сделать, внеся следующие изменения в my.cnf файл
[mysqld]
ignore-builtin-innodb
plugin-load=innodb=ha_innodb_plugin.so
plugin_dir=/path/to/plugin/directory