Это можно сделать довольно легко. Все, что я сделал, это переместил существующий каталог, не находящийся под контролем версий, во временный каталог. Затем я проверил версию SVN на свое правильное имя каталога, скопировал файлы из временного каталога в каталог SVN и восстановил файлы в каталоге SVN. Если это не имеет смысла, ниже приведен пример:
/usr/local/www
mv www temp_www
svn co http://www.yourrepo.com/therepo www
cp -pR ./temp_www/* ./www
svn revert -R ./www/*
svn update
Надеюсь, это поможет, и я не уверен, почему простое обновление SVN не вернуло файлы обратно?