Поскольку вы смотрите на довольно равномерное сочетание трафика чтения / записи, InnoDB является лучшим выбором. Блокировки полной таблицы MyISAM при каждой записи, вероятно, были бы убийством. MyISAM лучше справляется с ситуациями 90% + чтение или 90% + запись.
Я полагаю, что это упомянуто в Высокопроизводительный MySQL