Да, вы можете получить доступ к текстовым файлам на другом сервере, используя SSIS, используя файловый ресурс и доступ к файлам, используя имя общего ресурса, т.е. \\ServerB\MySSISFiles\
.
Необходимо убедиться, что учетная запись, под которой работает SSIS, имеет доступ к общей папке.