Если вы используете более старую версию Python:
print "%.6f" % 1.23456789
Если вы хотите использовать "e-обозначение", вы можете попробовать
print "%.6e" % 1.23456789
или
print "%.6E" % 1.23456789
Хотя сейчас я не уверен, что вы обладаете большой гибкостью с этим методом.