Если они не привязаны к одному из трех уровней, вы должны поместить их в каталог / lib.
Соглашение в / lib гласит, что вы должны называть свои папки как модули, а также файлы и классы и всегда пытаться инкапсулировать ваше дополнительное поведение в модулях. Допустим, у вас есть класс
module MyModule
class MyHelperClass
end
end
Вы должны поместить его в /lib/my_module/my_helper_class.rb