Это вообще не проблема; это способ, которым массивы (и другие объекты) работают в Python.
Подумайте об этом так: массив, который вы создали в своем примере кода, является объектом, который находится в некотором месте в памяти. Но вы не можете использовать его в своей программе, указав Python, где в памяти его искать; Вы должны дать ему имя. Когда ты пишешь
a = np.array([[1,2],[3,4]])
вы одновременно создаете массив и создаете имя, a, которое ссылается на него. С этого момента Python знает, что a относится к «адресу памяти 0x123674283» (или какому-либо другому). Во время выполнения Python есть внутренняя таблица (называемая «таблицей символов», если я правильно помню), которая содержит всю эту информацию, поэтому после выполнения приведенной выше строки кода Python эта таблица будет содержать
...,
'a' : 0x123674283,
...
Когда вы присваиваете значение одной переменной другой, например
b = a
Python не копирует весь массив, потому что если бы это был большой массив, это заняло бы много времени. Вместо этого он переходит в таблицу символов и копирует адрес памяти для a в новую строку в таблице для b. Таким образом, вы в конечном итоге с
...,
'a' : 0x123674283,
...,
'b' : 0x123674283,
...
Итак, вы видите, a и b фактически ссылаются на одно и то же место в памяти, то есть один и тот же объект. Любые изменения, внесенные вами в одно, будут отражены в другом, поскольку это всего лишь два имени для одной и той же вещи.
Если вы действительно хотите сделать копию массива, вам нужно вызвать метод, чтобы сделать это явно. В массивах Numpy есть метод copy, который вы можете использовать только для этой цели. Так что если вы напишите
b = a.copy()
тогда Python сначала фактически сделает копию массива, то есть выделит новую область памяти, скажем, по адресу 0x123904381, затем перейдет к адресу памяти 0x123674283 и скопирует все значения массива из последнего раздел памяти к прежнему. Таким образом, у вас один и тот же контент в двух разных местах памяти.
...,
'a' : 0x123674283,
...,
'b' : 0x123904381,
...
Теперь, когда вы измените один из элементов b, это изменение не будет отображаться в a, поскольку a и b больше не относятся к одному и тому же разделу памяти компьютера. Поскольку существует две независимые копии данных массива, вы можете изменить одну, не затрагивая другую.