Javascript интерпретируется как открытый текст. Таким образом, любое запутывание в лучшем случае является плацебо и легко может быть отменено.
Более того, если вы пишете достаточно Javascript, чтобы составить достаточно ценную для защиты работу, вы делаете что-то не так.
В наши дни мой Javascript включает в себя jQuery, несколько плагинов и некоторый код для активации этих плагинов и стилизации.
Мне трудно представить что-нибудь достаточно важное в Javascript, чтобы я заботился о его защите, что также хорошо, потому что вы не можете защитить его. Не совсем.