Я видел это в системе centos 6.4 с mysql 5.1 и файловой системой xfs.
Таблицы отображаются с «показом таблиц», но выбор или описание завершаются неудачно с сообщением «таблица не существует», как вы описали. Файлы там, где я их ожидаю.
Система работала нормально в течение нескольких месяцев, затем после перезапуска службы mysqld после изменения /etc/my.cnf, чтобы установить для table_cache значение 512 вместо 256, она пошла в сторону.
Согласно arcconf, контроллер рейда считает, что все в порядке. xfs_check не находит ничего. системный список событий IPMI понятен. dmesg показывает некоторые жалобы iptables на отслеживание соединений и отбрасывание пакетов, поэтому мы, возможно, были DOS'ами, но поскольку на сервере ничего не работает, я не понимаю, как это может повлиять на целостность данных mysql?
Я закончил тем, что продвинул ведомое устройство к управлению и перезагрузил систему, и теперь мне интересно, что могло вызвать ошибку, и если выбор xfs на centos 6.4 все еще остается стабильным выбором, или виновником был mysql 5.1.
О да, и никогда не меняйте работающую систему:)