JConsole для мониторинга JVM. Я предполагаю, что вы хотели бы контролировать производительность вашего сервера приложений. Для этого вам нужно будет установить свойство com.sun.management.jmxremote при инициализации сервера приложений.
Например, в Tomcat (я знаю, что это не полный контейнер Java EE), вы могли бы запустить контейнер как:
>startup.bat -Dcom.sun.management.jmxremote
Затем вы можете запустить JConsole как отдельное приложение
>jconsole
и затем присоедините jconsole к процессу Java, на котором выполняется Tomcat.
Аналогичные шаги применяются к другим серверам приложений.