Одним из способов сделать это может быть использование автоматического расширения имени файла оболочки:
java myjar.jar file[1-5]
Выше предполагается, что файлы заранее существуют в файловой системе.Или вы можете сделать что-то вроде:
java myjar.jar `for i in 1 2 3 4 5; do echo file$i; done`
Если у вас большое количество элементов, команда seq
поможет:
java myjar.jar `for i in $(seq 500); do echo file$i; done`