Что вы можете сделать, это использовать MS Expression Blend для создания шаблона по умолчанию для ComboBox. В шаблоне вы найдете всплывающее окно с именем Popup, измените его атрибут FlowDirection на RightToLeft ...
<Popup x:Name="Popup" FlowDirection="RightToLeft">
Обратите внимание, что объект ScrollViewer внутри Popup будет наследовать набор FlowDirection, поэтому вы должны явно установить его FlowDirection в LeftToRight ...
<ScrollViewer x:Name="ScrollViewer" BorderThickness="0" Padding="1" FlowDirection="LeftToRight">
... иначе он будет заполнен из RightToLeft, а полоса прокрутки будет на левой стороне.