Хотя я не пробовал XJC Axis2, я пробовал Sun, и я почти уверен, что ваш URL для схемы неверен: вам нужно три слеша (так как часть «Права» пропущена, так как это локальный ресурс с абсолютный путь)
Или, что еще проще, создайте файл и вызовите toURI () для него, например:
SchemaCompiler sc = XJC.createSchemaCompiler();
File file = new File("D:\\my-dir\\my-schema.xsd");
sc.setErrorListener(... );
sc.parseSchema(new InputSource(file.toURI().toString()));
S2JJAXBModel model = sc.bind();
JCodeModel cm = model.generateCode(null, null);
cm.build(new File("."));
Это произвело нужные файлы для меня. Вам нужен tools.jar на пути к классам. Счастливого поколения кода!