Простые текстовые файлы для хранения содержимого хорошо работают для контроля версий.Выберите формат, который легко читать и писать, разделить запятыми проще всего, если у вас нет 500 столбцов или чего-то в этом роде.
Но это оставляет вопрос загрузки.Если у вас простая ситуация, ваш скрипт обновления / установки может обрезать исходные таблицы и перезагрузить.Если это нехорошо из-за внешних ключей, вам придется написать небольшую подпрограмму, которая построчно просматривает текстовые файлы, вставляет новые значения и, возможно, перезаписывает измененные значения.