Гаррет, я столкнулся с этой проблемой, когда впервые установил Zend Server.Я не уверен на 100%, что ваша проблема такая же, как у меня, но, возможно, стоит проверить следующее.Это связано с тем, что Zend Studio не имеет разрешений на запись в htdocs Zend Server, поскольку он установлен с правами администратора.
Если вы находите свои файлы в: C: \ Users \ YOUR USERNAME \ appdata \ Local \VirtualStore \ Program Files \ Zend, у вас возникла та же проблема.Изменение разрешений каталога для вашего каталога htdocs должно разрешить его.
С другой стороны, это может быть что-то совершенно другое.