У меня была похожая проблема с IDEA 9. После долгих поисков я нашел странное решение: деактивировать панель инструментов и / или панель навигации. (Меню: Вид -> Панель инструментов, Панель навигации)
Это фактически решило это для меня. Объяснение было в том, что у IDEA была проблема с перестроением значков в тех барах, и они иногда зависали. Я не знаю, сохраняется ли проблема с IDEA 10, и я не знаю, решит ли она вашу проблему. Но, может быть, вы хотите попробовать. Деактивируйте эти два бара, перезапустите IDEA и посмотрите, не произойдут ли эти прерывания снова.