Не могли бы вы предоставить дополнительную информацию?
Например:
- когда вы имеете в виду «тот» магазин и «другой» магазин, вы имеете в виду два представления магазина в одной и той же установке или о двух разных установках?
- Возможно ли, что расширение удаляет ссылки в "этом" магазине?
- Возможно ли, что вы используете разные языки для двух магазинов?
Обе ссылки принадлежат клиентскому модулю. Может быть, есть разница в настройках клиента или (как бы то ни было) модуль клиента Magento деактивирован?
Будет полезен источник страницы или URL.