Я предполагаю, что classA и classB - это .as файлы. В этом случае вам вообще не нужно использовать опцию -includes - просто импортируйте их в свой основной класс (ClassC), как вы это обычно делаете, и компилируйте с помощью mxmlc com.example.ClassC из папки, содержащей папку com .
Согласно этой странице , опция -includes должна указывать список классов в результирующем SWF-файле приложения, независимо от того, требуются ли эти классы во время компиляции. Обычно класс в исходном пути компилируется, только если это требуется, то есть, только если он используется другим классом, являющимся компилятором. Эта опция указывает компилятору компилировать класс, даже если он не используется ни в одном из ваших классов - возможно, стоит использовать getDefinitionByName для создания экземпляров этого класса во время выполнения.